| 25. Journée | 21.02.2021 | 1. FC Magdeburg | - | SC Verl | 0:4 | ||||
| 26. Journée | 27.02.2021 | SV Wehen Wiesbaden | - | 1. FC Magdeburg | 1:0 | ||||
| 22. Journée | 02.03.2021 | Viktoria Köln | - | 1. FC Magdeburg | 2:4 |  |
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| 27. Journée | 06.03.2021 | 1. FC Magdeburg | - | Waldhof Mannheim | 1:1 |  |
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| 28. Journée | 13.03.2021 | Bayern München II | - | 1. FC Magdeburg | 0:2 | |
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| 29. Journée | 20.03.2021 | 1. FC Magdeburg | - | 1. FC Kaiserslautern | 1:0 | |
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| 30. Journée | 03.04.2021 | 1. FC Magdeburg | - | FC Ingolstadt 04 | 2:0 | |
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| 31. Journée | 10.04.2021 | Hansa Rostock | - | 1. FC Magdeburg | 0:2 | |
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| 32. Journée | 17.04.2021 | 1. FC Magdeburg | - | FSV Zwickau | 0:0 | |
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| 33. Journée | 21.04.2021 | SV Meppen | - | 1. FC Magdeburg | 1:2 | |
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| 34. Journée | 25.04.2021 | 1. FC Magdeburg | - | VfB Lübeck | 1:0 | ||||
| 35. Journée | 05.05.2021 | 1. FC Saarbrücken | - | 1. FC Magdeburg | 0:3 | |
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| 36. Journée | 08.05.2021 | 1. FC Magdeburg | - | MSV Duisburg | 3:2 | |
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| 37. Journée | 15.05.2021 | KFC Uerdingen 05 | - | 1. FC Magdeburg | 1:0 | ||||
| 38. Journée | 22.05.2021 | 1. FC Magdeburg | - | SpVgg Unterhaching | 1:1 |
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