| 24. Journée | 13.02.2021 | 1. FC Kaiserslautern | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 25. Journée | 21.02.2021 | Bayern München II | - | Viktoria Köln | 0:1 | ||||
| 22. Journée | 24.02.2021 | Dynamo Dresden | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 30. Journée | 03.04.2021 | Bayern München II | - | VfB Lübeck | 2:3 | ||||
| 31. Journée | 10.04.2021 | FC Ingolstadt 04 | - | Bayern München II | 2:2 | ||||
| 32. Journée | 16.04.2021 | Bayern München II | - | Hansa Rostock | 0:1 | ||||
| 33. Journée | 20.04.2021 | FSV Zwickau | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 34. Journée | 26.04.2021 | Bayern München II | - | 1. FC Saarbrücken | 0:4 | ||||
| 35. Journée | 05.05.2021 | MSV Duisburg | - | Bayern München II | 2:2 |  |
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| 36. Journée | 09.05.2021 | Bayern München II | - | SpVgg Unterhaching | 1:2 | ||||
| 37. Journée | 16.05.2021 | TSV 1860 München | - | Bayern München II | 2:2 | |
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| 38. Journée | 22.05.2021 | Bayern München II | - | Hallescher FC | 0:1 |
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