| 19. Journée | 01.03.2000 | Wacker Burghausen | - | Bayern München II | 2:0 | ||||
| 21. Journée | 05.03.2000 | TSV 1860 München II | - | Bayern München II | 4:3 |  |
|||
| 22. Journée | 12.03.2000 | Bayern München II | - | FC Augsburg | 3:0 | ||||
| 23. Journée | 17.03.2000 | Borussia Fulda | - | Bayern München II | 1:0 | ||||
| 24. Journée | 25.03.2000 | Bayern München II | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 2:0 | ||||
| 26. Journée | 12.04.2000 | Bayern München II | - | SV Wehen-Taunusstein | 5:0 | |
|||
| 27. Journée | 16.04.2000 | SV Lohhof | - | Bayern München II | 1:3 | ||||
| 25. Journée | 20.04.2000 | VfR Aalen | - | Bayern München II | 0:0 | ||||
| 29. Journée | 28.04.2000 | VfR Mannheim | - | Bayern München II | 3:3 | |
|||
| 30. Journée | 06.05.2000 | SSV Reutlingen | - | Bayern München II | 3:1 | |
|||
| 31. Journée | 14.05.2000 | Bayern München II | - | VfB Stuttgart II | 1:6 | |
|||
| 32. Journée | 17.05.2000 | FSV Frankfurt | - | Bayern München II | 2:3 | |
|||
| 33. Journée | 21.05.2000 | Bayern München II | - | Quelle Fürth | 3:0 | |
|||
| 34. Journée | 27.05.2000 | SC Pfullendorf | - | Bayern München II | 0:1 | |
Allemagne
Italie