| 25. Journée | 25.02.2006 | Preußen Münster | - | VfL Osnabrück | 2:1 | ||||
| 26. Journée | 04.03.2006 | SG Wattenscheid 09 | - | Preußen Münster | 0:2 | ||||
| 27. Journée | 10.03.2006 | Preußen Münster | - | Rot-Weiss Essen | 1:3 | ||||
| 28. Journée | 18.03.2006 | 1. FC Köln II | - | Preußen Münster | 0:2 | ||||
| 23. Journée | 21.03.2006 | Preußen Münster | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:1 |  |
|||
| 29. Journée | 25.03.2006 | Preußen Münster | - | FC St. Pauli | 1:2 | ||||
| 30. Journée | 02.04.2006 | Hamburger SV II | - | Preußen Münster | 0:2 | ||||
| 22. Journée | 05.04.2006 | Chemnitzer FC | - | Preußen Münster | 1:1 |  |
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| 31. Journée | 08.04.2006 | Preußen Münster | - | Werder Bremen II | 0:1 | ||||
| 32. Journée | 15.04.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | Preußen Münster | 1:1 | |
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| 33. Journée | 22.04.2006 | Preußen Münster | - | Kickers Emden | 0:1 | |
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| 34. Journée | 29.04.2006 | VfB Lübeck | - | Preußen Münster | 2:1 | ||||
| 35. Journée | 07.05.2006 | Preußen Münster | - | Fortuna Düsseldorf | 2:0 | ||||
| 36. Journée | 14.05.2006 | Rot-Weiß Oberhausen | - | Preußen Münster | 1:2 | |
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| 37. Journée | 20.05.2006 | Preußen Münster | - | Wuppertaler SV | 1:2 |
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