| 1. Journée | 13.07.2013 | SV Heimstetten | - | Bayern München II | 0:6 | ||||
| 30. Journée | 06.04.2014 | SpVgg Bayern Hof | - | Bayern München II | 0:2 | ||||
| 31. Journée | 12.04.2014 | Bayern München II | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 2:1 | ||||
| 33. Journée | 25.04.2014 | TSV 1896 Rain | - | Bayern München II | 1:5 | ||||
| 34. Journée | 28.04.2014 | Bayern München II | - | SV Seligenporten | 6:0 | ||||
| 35. Journée | 03.05.2014 | FV Illertissen | - | Bayern München II | 0:0 | ||||
| 36. Journée | 09.05.2014 | Bayern München II | - | FC Memmingen | 2:0 |  |
|||
| 37. Journée | 16.05.2014 | FC Augsburg II | - | Bayern München II | 2:0 | ||||
| 38. Journée | 24.05.2014 | Bayern München II | - | TSV 1860 Rosenheim | 1:1 |
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