| 1. Journée | 06.08.2006 | Atlante | - | Monarcas Morelia | 2:0 |  |
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| 2. Journée | 13.08.2006 | Monarcas Morelia | - | Club San Luis | 1:0 | ||||
| 3. Journée | 20.08.2006 | UANL Tigres | - | Monarcas Morelia | 2:1 | |
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| 4. Journée | 27.08.2006 | Monarcas Morelia | - | Atlas Guadalajara | 1:1 | |
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| 5. Journée | 31.08.2006 | Veracruz (old) | - | Monarcas Morelia | 1:0 | ||||
| 6. Journée | 03.09.2006 | Monarcas Morelia | - | Jaguares Chiapas | 2:1 |  |
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| 7. Journée | 10.09.2006 | Deportivo Toluca | - | Monarcas Morelia | 2:1 | |
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| 8. Journée | 14.09.2006 | Monarcas Morelia | - | Santos Laguna | 3:2 | ||||
| 9. Journée | 17.09.2006 | CF Pachuca | - | Monarcas Morelia | 2:0 | |
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| 10. Journée | 24.09.2006 | Monarcas Morelia | - | Cruz Azul | 4:4 | |
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| 12. Journée | 08.10.2006 | Monarcas Morelia | - | Deportivo Guadalajara | 3:2 | |
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| 14. Journée | 22.10.2006 | Monarcas Morelia | - | Gallos Blancos (old) | 2:0 | ||||
| 15. Journée | 29.10.2006 | Pumas UNAM | - | Monarcas Morelia | 1:0 | |
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| 16. Journée | 05.11.2006 | Monarcas Morelia | - | UAG Tecos | 2:1 | |
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| 13. Journée | 09.11.2006 | Club Necaxa | - | Monarcas Morelia | 1:3 | ||||
| 17. Journée | 12.11.2006 | CF América | - | Monarcas Morelia | 2:1 | |
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