| 1. Journée | 03.07.2016 | Patriotas FC | - | Millonarios | 1:0 | ||||
| 2. Journée | 10.07.2016 | Millonarios | - | Santa Fe | 1:0 | ||||
| 4. Journée | 18.07.2016 | Millonarios | - | Alianza Petrolera | 1:0 | ||||
| 11. Journée | 22.07.2016 | Millonarios | - | Once Caldas | 1:1 | ||||
| 5. Journée | 24.07.2016 | Jaguares de Córdoba | - | Millonarios | 2:1 | ||||
| 6. Journée | 31.07.2016 | Millonarios | - | Águilas Doradas | 0:0 | ||||
| 8. Journée | 14.08.2016 | Millonarios | - | Fortaleza FC | 3:2 |  |
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| 13. Journée | 18.08.2016 | Millonarios | - | Deportivo Cali | 1:0 | |
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| 9. Journée | 22.08.2016 | Atlético Nacional | - | Millonarios | 1:0 | ||||
| 12. Journée | 15.09.2016 | Boyacá Chicó | - | Millonarios | 0:1 | ||||
| 17. Journée | 24.10.2016 | Cortuluá | - | Millonarios | 2:3 | ||||
| 18. Journée | 31.10.2016 | Millonarios | - | La Equidad | 1:2 |  |
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| 19. Journée | 07.11.2016 | Atlético Huila | - | Millonarios | 0:3 | ||||
| 20. Journée | 21.11.2016 | Millonarios | - | Independiente Medellín | 3:1 |  |
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