| 20. Journée | 03.03.2009 | SSV Ulm 1846 | - | TSV Großbardorf | 2:1 | ||||
| 21. Journée | 07.03.2009 | SV Darmstadt 98 | - | SSV Ulm 1846 | 0:4 | ||||
| 22. Journée | 14.03.2009 | SSV Ulm 1846 | - | SV Wehen Wiesbaden II | 2:0 | ||||
| 23. Journée | 22.03.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | SSV Ulm 1846 | 0:0 | ||||
| 24. Journée | 28.03.2009 | SSV Ulm 1846 | - | Karlsruher SC II | 6:1 | ||||
| 25. Journée | 05.04.2009 | 1. FC Nürnberg II | - | SSV Ulm 1846 | 2:2 | ||||
| 18. Journée | 14.04.2009 | SSV Ulm 1846 | - | SSV Reutlingen | 3:0 |  |
|||
| 26. Journée | 18.04.2009 | SSV Ulm 1846 | - | SC Pfullendorf | 3:4 | ||||
| 28. Journée | 01.05.2009 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | SSV Ulm 1846 | 1:0 |  |
|||
| 29. Journée | 08.05.2009 | SSV Ulm 1846 | - | TSV 1860 München II | 3:0 | ||||
| 30. Journée | 13.05.2009 | Hessen Kassel | - | SSV Ulm 1846 | 3:0 | ||||
| 31. Journée | 16.05.2009 | SSV Ulm 1846 | - | SC Freiburg II | 3:1 | |
|||
| 32. Journée | 23.05.2009 | SpVgg Greuther Fürth II | - | SSV Ulm 1846 | 1:1 | ||||
| 19. Journée | 26.05.2009 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | SSV Ulm 1846 | 1:1 | ||||
| 33. Journée | 30.05.2009 | SSV Ulm 1846 | - | Waldhof Mannheim | 0:1 | ||||
| 34. Journée | 06.06.2009 | Eintracht Frankfurt II | - | SSV Ulm 1846 | 3:1 |
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