| 3. Journée | 30.08.2008 | KV Mechelen | - | SV Zulte Waregem | 0:2 |  |
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| 4. Journée | 14.09.2008 | SV Zulte Waregem | - | KRC Genk | 1:3 | ||||
| 5. Journée | 20.09.2008 | FCV Dender EH | - | SV Zulte Waregem | 2:0 | ||||
| 6. Journée | 27.09.2008 | SV Zulte Waregem | - | AFC Tubize | 1:0 | |
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| 8. Journée | 19.10.2008 | SV Zulte Waregem | - | RSC Anderlecht | 4:0 | |
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| 9. Journée | 25.10.2008 | KSV Roeselare | - | SV Zulte Waregem | 0:3 | ||||
| 10. Journée | 02.11.2008 | SV Zulte Waregem | - | KAA Gent | 0:2 | ||||
| 11. Journée | 07.11.2008 | Cercle Brugge | - | SV Zulte Waregem | 2:0 | ||||
| 12. Journée | 15.11.2008 | SV Zulte Waregem | - | Germinal Beerschot | 2:2 | ||||
| 14. Journée | 29.11.2008 | SV Zulte Waregem | - | Sporting Charleroi | 4:2 | ||||
| 15. Journée | 06.12.2008 | Standard Liège | - | SV Zulte Waregem | 1:2 | ||||
| 16. Journée | 13.12.2008 | SV Zulte Waregem | - | Excelsior Mouscron | 2:1 | ||||
| 13. Journée | 16.12.2008 | KV Kortrijk | - | SV Zulte Waregem | 1:0 | ||||
| 18. Journée | 17.01.2009 | Sporting Lokeren | - | SV Zulte Waregem | 2:1 |
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