| 1. Journée | 30.08.2008 | RC Celta | - | Girona FC | 0:1 | ||||
| 3. Journée | 14.09.2008 | Albacete | - | Girona FC | 1:1 |  |
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| 10. Journée | 01.11.2008 | Girona FC | - | Real Zaragoza | 1:0 | ||||
| 11. Journée | 08.11.2008 | Real Murcia | - | Girona FC | 2:0 | ||||
| 12. Journée | 16.11.2008 | Girona FC | - | Hércules CF | 1:0 | ||||
| 13. Journée | 23.11.2008 | CD Alavés | - | Girona FC | 1:0 | ||||
| 14. Journée | 29.11.2008 | Girona FC | - | Sevilla Atlético | 1:0 | |
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| 27. Journée | 07.03.2009 | Rayo Vallecano | - | Girona FC | 1:1 | ||||
| 28. Journée | 15.03.2009 | Girona FC | - | Levante UD | 0:0 | ||||
| 29. Journée | 22.03.2009 | Real Sociedad | - | Girona FC | 2:0 | ||||
| 32. Journée | 11.04.2009 | Girona FC | - | Real Murcia | 1:0 | ||||
| 33. Journée | 19.04.2009 | Hércules CF | - | Girona FC | 3:0 | ||||
| 34. Journée | 25.04.2009 | Girona FC | - | CD Alavés | 0:1 | ||||
| 36. Journée | 10.05.2009 | Girona FC | - | Xerez CD | 0:2 | ||||
| 39. Journée | 30.05.2009 | Girona FC | - | Gimnàstic de Tarragona | 2:1 | ||||
| 40. Journée | 07.06.2009 | SD Eibar | - | Girona FC | 2:2 | |
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| 41. Journée | 13.06.2009 | Girona FC | - | CD Tenerife | 0:1 | ||||
| 42. Journée | 20.06.2009 | SD Huesca | - | Girona FC | 3:1 |
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