| 6. Journée | 02.10.2011 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | VfL Wolfsburg [A-jeun] | 1:2 | ||||
| 7. Journée | 22.10.2011 | Hannover 96 [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 3:1 | ||||
| 8. Journée | 30.10.2011 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | Hallescher FC [A-jeun] | 0:0 | ||||
| 9. Journée | 06.11.2011 | VfL Osnabrück [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 1:3 | ||||
| 10. Journée | 19.11.2011 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | Hertha Zehlendorf [A-jeun] | 3:0 | ||||
| 14. Journée | 12.02.2012 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | Energie Cottbus [A-jeun] | 4:4 | ||||
| 15. Journée | 19.02.2012 | Werder Bremen [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 1:3 | ||||
| 16. Journée | 26.02.2012 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | Hamburger SV [A-jeun] | 1:0 | ||||
| 17. Journée | 03.03.2012 | Hansa Rostock [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 5:0 | ||||
| 18. Journée | 05.04.2012 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | Hertha BSC [A-jeun] | 0:3 | ||||
| 24. Journée | 06.05.2012 | VfL Oldenburg [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 1:4 |  |
|||
| 25. Journée | 20.05.2012 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | Rot-Weiß Erfurt [A-jeun] | 3:0 | ||||
| 26. Journée | 03.06.2012 | 1. FC Union Berlin [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 2:2 |
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