| 1. Journée | 14.08.1999 | Bayern München | - | Hamburger SV | 2:2 | ||||
| 11. Journée | 06.11.1999 | SSV Ulm 1846 | - | Bayern München | 0:1 |  |
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| 12. Journée | 20.11.1999 | Bayern München | - | SC Freiburg | 6:1 |  |
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| 13. Journée | 27.11.1999 | TSV 1860 München | - | Bayern München | 1:0 | ||||
| 14. Journée | 04.12.1999 | Bayern München | - | Borussia Dortmund | 1:1 | |
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| 17. Journée | 17.12.1999 | Werder Bremen | - | Bayern München | 0:2 | ||||
| 18. Journée | 06.02.2000 | Hamburger SV | - | Bayern München | 0:0 | ||||
| 19. Journée | 09.02.2000 | Bayern München | - | Bayer Leverkusen | 4:1 | |
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| 20. Journée | 12.02.2000 | SpVgg Unterhaching | - | Bayern München | 0:2 | ||||
| 21. Journée | 19.02.2000 | Bayern München | - | MSV Duisburg | 4:1 | |
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| 22. Journée | 26.02.2000 | Bayern München | - | Eintracht Frankfurt | 4:1 | |
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| 24. Journée | 11.03.2000 | Bayern München | - | FC Schalke 04 | 4:1 | |
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| 25. Journée | 18.03.2000 | Hertha BSC | - | Bayern München | 1:1 | ||||
| 34. Journée | 20.05.2000 | Bayern München | - | Werder Bremen | 3:1 |
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