| 4. Journée | 16.09.2012 | 1. FC Lok Leipzig | - | Energie Cottbus II | 0:1 | ||||
| 7. Journée | 07.10.2012 | Energie Cottbus II | - | VfB Auerbach | 1:1 | ||||
| 8. Journée | 21.10.2012 | ZFC Meuselwitz | - | Energie Cottbus II | 2:1 | ||||
| 9. Journée | 28.10.2012 | Energie Cottbus II | - | VFC Plauen | 0:1 | ||||
| 10. Journée | 04.11.2012 | Hertha BSC II | - | Energie Cottbus II | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 10.11.2012 | Energie Cottbus II | - | Torgelower SV Greif | 2:2 |  |
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| 12. Journée | 16.11.2012 | RB Leipzig | - | Energie Cottbus II | 3:0 | ||||
| 13. Journée | 23.11.2012 | 1. FC Magdeburg | - | Energie Cottbus II | 2:2 | |
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| 23. Journée | 07.04.2013 | Energie Cottbus II | - | ZFC Meuselwitz | 2:3 | ||||
| 24. Journée | 14.04.2013 | VFC Plauen | - | Energie Cottbus II | 2:0 |  |
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| 18. Journée | 17.04.2013 | TSG Neustrelitz | - | Energie Cottbus II | 3:0 | ||||
| 22. Journée | 24.04.2013 | VfB Auerbach | - | Energie Cottbus II | 0:1 | ||||
| 21. Journée | 02.05.2013 | Energie Cottbus II | - | Germania Halberstadt | 0:1 |
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