| 7. Journée | 02.09.2009 | Jahn Regensburg | - | Werder Bremen II | 1:0 | ||||
| 9. Journée | 12.09.2009 | FC Ingolstadt 04 | - | Werder Bremen II | 4:1 | ||||
| 8. Journée | 15.09.2009 | Werder Bremen II | - | Kickers Offenbach | 0:1 | ||||
| 10. Journée | 19.09.2009 | Werder Bremen II | - | SpVgg Unterhaching | 3:1 | ||||
| 11. Journée | 26.09.2009 | FC Carl Zeiss Jena | - | Werder Bremen II | 2:2 |  |
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| 12. Journée | 03.10.2009 | Werder Bremen II | - | Dynamo Dresden | 2:0 | |
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| 13. Journée | 17.10.2009 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | Werder Bremen II | 1:2 | ||||
| 14. Journée | 24.10.2009 | Werder Bremen II | - | Wuppertaler SV | 0:1 | ||||
| 15. Journée | 30.10.2009 | VfB Stuttgart II | - | Werder Bremen II | 0:1 | |
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| 16. Journée | 07.11.2009 | Werder Bremen II | - | SV Wehen Wiesbaden | 5:0 | ||||
| 17. Journée | 21.11.2009 | SV Sandhausen | - | Werder Bremen II | 2:2 | |
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| 18. Journée | 29.11.2009 | Werder Bremen II | - | Bayern München II | 0:3 | ||||
| 19. Journée | 05.12.2009 | Erzgebirge Aue | - | Werder Bremen II | 2:1 |  |
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