| 5. Journée | 27.08.2016 | Preußen Münster | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:0 | ||||
| 21. Journée | 04.02.2017 | 1. FSV Mainz 05 II | - | SC Paderborn 07 | 0:1 | ||||
| 22. Journée | 10.02.2017 | VfL Osnabrück | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:2 | ||||
| 23. Journée | 17.02.2017 | 1. FSV Mainz 05 II | - | MSV Duisburg | 0:2 | ||||
| 25. Journée | 04.03.2017 | 1. FC Magdeburg | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:2 | ||||
| 26. Journée | 11.03.2017 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Werder Bremen II | 0:1 |  |
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