| 9. Journée | 08.09.2023 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | Wacker Burghausen | 2:1 |  |
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| 10. Journée | 15.09.2023 | Wacker Burghausen | - | Türkgücü München | 0:3 |  |
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| 7. Journée | 19.09.2023 | Wacker Burghausen | - | SpVgg Greuther Fürth II | 1:0 | ||||
| 11. Journée | 22.09.2023 | Würzburger Kickers | - | Wacker Burghausen | 3:0 | ||||
| 12. Journée | 29.09.2023 | Wacker Burghausen | - | 1. FC Nürnberg II | 1:4 | ||||
| 13. Journée | 03.10.2023 | SpVgg Bayreuth | - | Wacker Burghausen | 1:1 | ||||
| 14. Journée | 07.10.2023 | Wacker Burghausen | - | SV Schalding-Heining | 3:0 | ||||
| 17. Journée | 21.10.2023 | FC Augsburg II | - | Wacker Burghausen | 3:1 | ||||
| 18. Journée | 27.10.2023 | Bayern München II | - | Wacker Burghausen | 4:1 | ||||
| 19. Journée | 04.11.2023 | Wacker Burghausen | - | FV Illertissen | 3:2 | ||||
| 20. Journée | 11.11.2023 | TSV Aubstadt | - | Wacker Burghausen | 0:1 | ||||
| 21. Journée | 17.11.2023 | Wacker Burghausen | - | SpVgg Ansbach | 0:0 | ||||
| 22. Journée | 25.11.2023 | Viktoria Aschaffenburg | - | Wacker Burghausen | 1:1 | ||||
| 27. Journée | 30.03.2024 | Türkgücü München | - | Wacker Burghausen | 0:4 |
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