| 1. Journée | 13.08.2006 | FC Gütersloh 2000 | - | FC Schalke 04 II | 2:0 | ||||
| 2. Journée | 20.08.2006 | FC Schalke 04 II | - | SV Lippstadt 08 | 3:0 | ||||
| 3. Journée | 27.08.2006 | Hammer SpVg | - | FC Schalke 04 II | 4:1 | ||||
| 4. Journée | 03.09.2006 | FC Schalke 04 II | - | SF Oestrich-Iserlohn | 1:1 | ||||
| 5. Journée | 10.09.2006 | SpVgg Erkenschwick | - | FC Schalke 04 II | 0:3 |  |
|||
| 6. Journée | 17.09.2006 | FC Schalke 04 II | - | Arminia Bielefeld II | 1:0 | ||||
| 7. Journée | 24.09.2006 | SV Emsdetten 05 | - | FC Schalke 04 II | 1:1 | ||||
| 8. Journée | 01.10.2006 | FC Schalke 04 II | - | VfL Bochum II | 4:2 | |
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| 9. Journée | 15.10.2006 | SC Verl | - | FC Schalke 04 II | 2:1 | ||||
| 13. Journée | 12.11.2006 | VfB Hüls | - | FC Schalke 04 II | 0:5 | ||||
| 14. Journée | 19.11.2006 | FC Schalke 04 II | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 16. Journée | 10.12.2006 | Sportfreunde Lotte | - | FC Schalke 04 II | 1:2 | |
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| 17. Journée | 17.12.2006 | FC Schalke 04 II | - | SG Wattenscheid 09 | 4:2 |
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