| 4. Journée | 08.04.2006 | FK Saturn | - | Shinnik Yaroslavl | 3:0 | ||||
| 5. Journée | 16.04.2006 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Amkar Perm | 0:0 | ||||
| 6. Journée | 23.04.2006 | FK Rostov | - | Shinnik Yaroslavl | 0:0 | ||||
| 7. Journée | 30.04.2006 | Shinnik Yaroslavl | - | Krylia Sovetov | 1:0 | ||||
| 8. Journée | 07.05.2006 | Luch-Energiya Vladivostok | - | Shinnik Yaroslavl | 1:0 | ||||
| 9. Journée | 13.05.2006 | Shinnik Yaroslavl | - | Spartak Nalchik | 0:1 | ||||
| 10. Journée | 12.07.2006 | Spartak Moskva | - | Shinnik Yaroslavl | 3:1 | ||||
| 11. Journée | 16.07.2006 | Shinnik Yaroslavl | - | Lokomotiv Moskva | 1:3 |  |
|||
| 29. Journée | 18.11.2006 | Shinnik Yaroslavl | - | Zenit St. Petersburg | 1:2 | ||||
| 30. Journée | 25.11.2006 | Torpedo Moskva | - | Shinnik Yaroslavl | 1:1 |
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