| 1. Journée | 30.07.2016 | Jahn Regensburg | - | Hansa Rostock | 2:0 | ||||
| 2. Journée | 05.08.2016 | Hansa Rostock | - | Preußen Münster | 1:0 |  |
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| 3. Journée | 10.08.2016 | Hansa Rostock | - | SG Sonnenhof Großaspach | 0:0 | ||||
| 5. Journée | 27.08.2016 | Hansa Rostock | - | FSV Frankfurt | 1:1 | ||||
| 7. Journée | 17.09.2016 | Hansa Rostock | - | Sportfreunde Lotte | 1:3 | ||||
| 16. Journée | 25.11.2016 | SV Wehen Wiesbaden | - | Hansa Rostock | 1:1 | ||||
| 17. Journée | 03.12.2016 | Hansa Rostock | - | Holstein Kiel | 1:4 | ||||
| 18. Journée | 10.12.2016 | Rot-Weiß Erfurt | - | Hansa Rostock | 1:2 | ||||
| 19. Journée | 17.12.2016 | Hansa Rostock | - | Chemnitzer FC | 1:3 | ||||
| 25. Journée | 04.03.2017 | Hansa Rostock | - | VfR Aalen | 1:1 | ||||
| 27. Journée | 15.03.2017 | Hansa Rostock | - | Fortuna Köln | 1:1 |
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