| 3. Journée | 03.04.2016 | Irtysh Pavlodar | - | FK Atyrau | 3:0 | ||||
| 6. Journée | 17.04.2016 | FK Atyrau | - | FK Akzhayik | 2:0 | ||||
| 7. Journée | 23.04.2016 | FK Taraz | - | FK Atyrau | 0:0 | ||||
| 8. Journée | 01.05.2016 | Shakter Karaganda | - | FK Atyrau | 0:0 | ||||
| 9. Journée | 05.05.2016 | FK Atyrau | - | FK Ordabasy | 2:2 | ||||
| 10. Journée | 09.05.2016 | FK Aktobe | - | FK Atyrau | 1:0 | ||||
| 11. Journée | 15.05.2016 | FK Atyrau | - | FK Astana | 1:0 | ||||
| 12. Journée | 21.05.2016 | Tobyl Kostanay | - | FK Atyrau | 1:2 |  |
|||
| 13. Journée | 29.05.2016 | FK Atyrau | - | Irtysh Pavlodar | 0:1 | ||||
| 14. Journée | 02.06.2016 | FK Kairat | - | FK Atyrau | 5:2 | ||||
| 15. Journée | 11.06.2016 | FK Atyrau | - | FK Okzhetpes | 2:1 | ||||
| 16. Journée | 15.06.2016 | FK Akzhayik | - | FK Atyrau | 0:4 | ||||
| 17. Journée | 19.06.2016 | FK Atyrau | - | FK Taraz | 1:0 | |
|||
| 18. Journée | 25.06.2016 | FK Atyrau | - | Shakter Karaganda | 0:0 | ||||
| 2. Journée | 29.06.2016 | FK Atyrau | - | Tobyl Kostanay | 0:0 | ||||
| 19. Journée | 03.07.2016 | FK Ordabasy | - | FK Atyrau | 2:1 | ||||
| 20. Journée | 10.07.2016 | FK Atyrau | - | FK Aktobe | 1:1 |
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