| 4. Journée | 11.09.2016 | Mérida AD | - | Granada CF B | 1:0 | ||||
| 17. Journée | 04.12.2016 | Atlético Mancha Real | - | Mérida AD | 0:1 |  |
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| 22. Journée | 22.01.2017 | Mérida AD | - | UD Melilla | 0:0 | ||||
| 23. Journée | 28.01.2017 | Granada CF B | - | Mérida AD | 3:0 | ||||
| 25. Journée | 12.02.2017 | FC Cartagena | - | Mérida AD | 1:2 | ||||
| 26. Journée | 19.02.2017 | Mérida AD | - | Marbella FC | 3:0 | |
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| 27. Journée | 26.02.2017 | Real Jaén | - | Mérida AD | 0:1 | |
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| 28. Journée | 05.03.2017 | Mérida AD | - | Atlético Sanluqueño CF | 0:0 | ||||
| 29. Journée | 12.03.2017 | Extremadura UD | - | Mérida AD | 1:1 | ||||
| 30. Journée | 19.03.2017 | Mérida AD | - | CF Villanovense | 2:2 | ||||
| 31. Journée | 26.03.2017 | FC Jumilla | - | Mérida AD | 0:1 | |
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| 32. Journée | 02.04.2017 | Mérida AD | - | RB Linense | 5:1 | ||||
| 33. Journée | 08.04.2017 | Recreativo Huelva | - | Mérida AD | 1:1 | ||||
| 34. Journée | 16.04.2017 | Mérida AD | - | Linares Deportivo | 1:0 | ||||
| 35. Journée | 23.04.2017 | Córdoba CF B | - | Mérida AD | 1:0 | ||||
| 36. Journée | 30.04.2017 | Mérida AD | - | Atlético Mancha Real | 3:0 | ||||
| 37. Journée | 07.05.2017 | CD El Ejido 2012 | - | Mérida AD | 0:0 | ||||
| 38. Journée | 14.05.2017 | Mérida AD | - | La Roda CF | 3:0 |  |
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