| 3. Journée | 12.08.2006 | Bradford City | - | Gillingham FC | 4:2 | ||||
| 5. Journée | 26.08.2006 | Blackpool FC | - | Gillingham FC | 1:1 | ||||
| 6. Journée | 01.09.2006 | Gillingham FC | - | Scunthorpe United | 0:2 | ||||
| 7. Journée | 09.09.2006 | Doncaster Rovers | - | Gillingham FC | 1:2 | ||||
| 13. Journée | 07.10.2006 | Crewe Alexandra | - | Gillingham FC | 4:3 |  |
|||
| 17. Journée | 04.11.2006 | Gillingham FC | - | Chesterfield FC | 2:1 | ||||
| 21. Journée | 09.12.2006 | Yeovil Town | - | Gillingham FC | 2:0 | ||||
| 24. Journée | 26.12.2006 | Gillingham FC | - | Leyton Orient | 2:1 |  |
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