| 1. Journée | 26.07.2008 | FC St. Gallen | - | FC Concordia Basel | 2:0 | ||||
| 2. Journée | 04.08.2008 | FC Wohlen | - | FC St. Gallen | 1:3 |  |
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| 3. Journée | 09.08.2008 | Yverdon Sport FC | - | FC St. Gallen | 0:4 | |
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| 4. Journée | 16.08.2008 | FC St. Gallen | - | FC Biel/Bienne | 4:0 | ||||
| 5. Journée | 23.08.2008 | FC Locarno | - | FC St. Gallen | 1:2 | |
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| 6. Journée | 30.08.2008 | FC St. Gallen | - | FC La Chaux-de-Fonds | 4:0 | ||||
| 7. Journée | 14.09.2008 | FC Thun | - | FC St. Gallen | 4:2 | ||||
| 8. Journée | 29.09.2008 | FC Schaffhausen | - | FC St. Gallen | 0:1 | ||||
| 9. Journée | 04.10.2008 | FC St. Gallen | - | FC Stade Nyonnais | 3:0 | ||||
| 10. Journée | 25.10.2008 | FC St. Gallen | - | Servette FC | 2:0 | ||||
| 11. Journée | 02.11.2008 | FC Gossau | - | FC St. Gallen | 1:3 | |
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| 12. Journée | 10.11.2008 | FC St. Gallen | - | FC Wil 1900 | 0:0 | ||||
| 13. Journée | 17.11.2008 | FC Lausanne-Sport | - | FC St. Gallen | 0:5 | |
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| 14. Journée | 01.12.2008 | FC St. Gallen | - | FC Lugano | 2:1 | ||||
| 15. Journée | 07.12.2008 | FC Winterthur | - | FC St. Gallen | 0:2 |  |
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| 19. Journée | 14.03.2009 | FC St. Gallen | - | FC Locarno | 1:0 | ||||
| 16. Journée | 29.03.2009 | FC St. Gallen | - | FC Wohlen | 4:0 |
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