| 1. Journée | 18.01.2004 | Atlas Guadalajara | - | Puebla FC | 1:1 |  |
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| 2. Journée | 25.01.2004 | Puebla FC | - | Real San Luis | 1:2 | ||||
| 3. Journée | 01.02.2004 | Santos Laguna | - | Puebla FC | 2:0 | |
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| 4. Journée | 08.02.2004 | Puebla FC | - | Atlante | 1:1 | ||||
| 5. Journée | 14.02.2004 | Jaguares Chiapas | - | Puebla FC | 3:1 | ||||
| 6. Journée | 22.02.2004 | Puebla FC | - | CF Pachuca | 3:0 | |
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| 7. Journée | 26.02.2004 | Monarcas Morelia | - | Puebla FC | 1:0 | ||||
| 8. Journée | 29.02.2004 | Puebla FC | - | Gallos Blancos (old) | 1:0 | ||||
| 9. Journée | 07.03.2004 | UANL Tigres | - | Puebla FC | 2:3 | |
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| 10. Journée | 14.03.2004 | Puebla FC | - | Deportivo Toluca | 1:2 | ||||
| 11. Journée | 21.03.2004 | Deportivo Guadalajara | - | Puebla FC | 0:0 | ||||
| 12. Journée | 28.03.2004 | Puebla FC | - | Club Necaxa | 2:2 | |
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| 13. Journée | 04.04.2004 | Puebla FC | - | Club Irapuato | 6:0 | ||||
| 14. Journée | 11.04.2004 | Pumas UNAM | - | Puebla FC | 3:0 | |
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| 15. Journée | 18.04.2004 | Puebla FC | - | Cruz Azul | 3:2 | |
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| 16. Journée | 24.04.2004 | Veracruz (old) | - | Puebla FC | 2:1 | |
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| 18. Journée | 09.05.2004 | CF Monterrey | - | Puebla FC | 2:2 | ||||
| 19. Journée | 16.05.2004 | Puebla FC | - | CF América | 1:3 |
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