| 16. Journée | 18.01.2017 | Xanthi FC | - | AEP Iraklis FC | 3:1 | ||||
| 17. Journée | 21.01.2017 | AEP Iraklis FC | - | Veria FC | 1:1 | ||||
| 2. Journée | 25.01.2017 | Veria FC | - | AEP Iraklis FC | 0:2 | ||||
| 18. Journée | 28.01.2017 | AEP Iraklis FC | - | AE Lárissa | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 01.02.2017 | AEP Iraklis FC | - | AO Kerkyra | 0:0 | ||||
| 19. Journée | 05.02.2017 | Olympiakos Piraeus | - | AEP Iraklis FC | 3:0 | ||||
| 20. Journée | 13.02.2017 | AEP Iraklis FC | - | AEK Athen | 2:2 | ||||
| 21. Journée | 19.02.2017 | Panionios GSS | - | AEP Iraklis FC | 1:0 | ||||
| 22. Journée | 26.02.2017 | AEP Iraklis FC | - | PAOK Saloniki | 1:1 |  |
|||
| 23. Journée | 05.03.2017 | Atromitos | - | AEP Iraklis FC | 1:0 | ||||
| 24. Journée | 11.03.2017 | AEP Iraklis FC | - | Panathinaikos | 1:1 | ||||
| 25. Journée | 20.03.2017 | Platanias Chanion | - | AEP Iraklis FC | 1:0 | ||||
| 26. Journée | 02.04.2017 | AO Kerkyra | - | AEP Iraklis FC | 0:3 | ||||
| 27. Journée | 05.04.2017 | AEP Iraklis FC | - | Levadiakos | 1:0 | ||||
| 28. Journée | 09.04.2017 | PAS Giannina | - | AEP Iraklis FC | 1:2 | ||||
| 29. Journée | 23.04.2017 | AEP Iraklis FC | - | Panetolikos | 2:1 | ||||
| 30. Journée | 30.04.2017 | Asteras Tripolis | - | AEP Iraklis FC | 2:2 |
Grèce