| 27. Journée | 31.01.2006 | Bristol Rovers | - | Leyton Orient | 3:3 |  |
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| 31. Journée | 04.02.2006 | Torquay United | - | Leyton Orient | 2:0 | ||||
| 36. Journée | 04.03.2006 | Shrewsbury Town | - | Leyton Orient | 3:3 |  |
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| 37. Journée | 11.03.2006 | Leyton Orient | - | Cheltenham Town | 1:0 | ||||
| 38. Journée | 18.03.2006 | Rushden & Diamonds FC | - | Leyton Orient | 1:0 | |
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| 42. Journée | 15.04.2006 | Mansfield Town | - | Leyton Orient | 0:1 | ||||
| 43. Journée | 17.04.2006 | Leyton Orient | - | Grimsby Town | 0:0 | ||||
| 44. Journée | 22.04.2006 | Lincoln City | - | Leyton Orient | 1:1 | ||||
| 45. Journée | 29.04.2006 | Leyton Orient | - | Peterborough United | 2:1 | ||||
| 46. Journée | 06.05.2006 | Oxford United | - | Leyton Orient | 2:3 |
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