| 5. Journée | 05.10.2008 | Panthrakikos | - | Panionios GSS | 1:0 |  |
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| 6. Journée | 19.10.2008 | Olympiakos Piraeus | - | Panthrakikos | 2:0 | ||||
| 7. Journée | 25.10.2008 | AE Lárissa | - | Panthrakikos | 1:2 | ||||
| 8. Journée | 02.11.2008 | Panthrakikos | - | Thrasyvoulos Fylis | 1:0 | ||||
| 11. Journée | 22.11.2008 | Panserraikos | - | Panthrakikos | 1:2 | ||||
| 13. Journée | 07.12.2008 | AEK Athen | - | Panthrakikos | 1:0 | ||||
| 14. Journée | 14.12.2008 | Levadiakos | - | Panthrakikos | 2:0 | |
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| 15. Journée | 21.12.2008 | Panthrakikos | - | Aris Saloniki | 0:0 | ||||
| 16. Journée | 03.01.2009 | Ergotelis | - | Panthrakikos | 0:1 | |
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| 18. Journée | 18.01.2009 | PAOK Saloniki | - | Panthrakikos | 2:0 |  |
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| 25. Journée | 08.03.2009 | Skoda Xanthi | - | Panthrakikos | 1:0 | |
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| 26. Journée | 15.03.2009 | Panthrakikos | - | Panserraikos | 2:1 | ||||
| 28. Journée | 05.04.2009 | Panthrakikos | - | AEK Athen | 1:1 | ||||
| 29. Journée | 12.04.2009 | Panthrakikos | - | Levadiakos | 1:3 | ||||
| 30. Journée | 26.04.2009 | Aris Saloniki | - | Panthrakikos | 3:2 |
Grèce