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| H (Match allé) | Chelsea FC | - | DWS Amsterdam | 0:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | DWS Amsterdam | - | Chelsea FC | 0:0 (0:0, 0:0) ap | ||
| H (Match allé): 23.10.1968 | R (match retour): 30.10.1968 | |||||
| H (Match allé) | Aberdeen FC | - | Real Zaragoza | 2:1 (1:0) | ||
| R (match retour) | Real Zaragoza | - | Aberdeen FC | 3:0 (2:0) | ||
| H (Match allé): 23.10.1968 | R (match retour): 30.10.1968 | vainqueur: Real Zaragoza | ||||
| H (Match allé) | Göztepe | - | Argeș Pitești | 3:0 (3:0) | ||
| R (match retour) | Argeș Pitești | - | Göztepe | 3:2 (0:1) | ||
| H (Match allé): 30.10.1968 | R (match retour): 13.11.1968 | vainqueur: Göztepe | ||||
| H (Match allé) | Rangers FC | - | Dundalk FC | 6:1 (2:1) | ||
| R (match retour) | Dundalk FC | - | Rangers FC | 0:3 (0:1) | ||
| H (Match allé): 30.10.1968 | R (match retour): 13.11.1968 | vainqueur: Rangers FC | ||||
| H (Match allé) | Vitória Setúbal | - | Olympique Lyonnais | 5:0 (2:0) | ||
| R (match retour) | Olympique Lyonnais | - | Vitória Setúbal | 1:2 (1:1) | ||
| H (Match allé): 30.10.1968 | R (match retour): 13.11.1968 | vainqueur: Vitória Setúbal | ||||
| H (Match allé) | Sporting CP | - | Newcastle United | 1:1 (0:1) | ||
| R (match retour) | Newcastle United | - | Sporting CP | 1:0 (1:0) | ||
| H (Match allé): 30.10.1968 | R (match retour): 20.11.1968 | vainqueur: Newcastle United | ||||
| H (Match allé) | KSV Waregem | - | Legia Warszawa | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Legia Warszawa | - | KSV Waregem | 2:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 06.11.1968 | R (match retour): 12.11.1968 | vainqueur: Legia Warszawa | ||||
| H (Match allé) | Aris Saloniki | - | Újpesti Dózsa SC | 1:2 (0:1) | ||
| R (match retour) | Újpesti Dózsa SC | - | Aris Saloniki | 9:1 (4:1) | ||
| H (Match allé): 06.11.1968 | R (match retour): 20.11.1968 | vainqueur: Újpesti Dózsa SC | ||||
| H (Match allé) | OFK Beograd | - | Bologna FC | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Bologna FC | - | OFK Beograd | 1:1 (1:0) | ||
| H (Match allé): 06.11.1968 | R (match retour): 20.11.1968 | vainqueur: OFK Beograd | ||||
| H (Match allé) | Juventus | - | Eintracht Frankfurt | 0:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Eintracht Frankfurt | - | Juventus | 1:0 (0:0, 0:0) ap | ||
| H (Match allé): 06.11.1968 | R (match retour): 21.11.1968 | vainqueur: Eintracht Frankfurt | ||||
| H (Match allé) | AIK Solna | - | Hannover 96 | 4:2 (0:0) | ||
| R (match retour) | Hannover 96 | - | AIK Solna | 5:2 (2:1) | ||
| H (Match allé): 12.11.1968 | R (match retour): 19.11.1968 | vainqueur: Hannover 96 | ||||
| H (Match allé) | Hibernian FC | - | 1. FC Lokomotive Leipzig | 3:1 (3:0) | ||
| R (match retour) | 1. FC Lokomotive Leipzig | - | Hibernian FC | 0:1 (0:1) | ||
| H (Match allé): 13.11.1968 | R (match retour): 20.11.1968 | vainqueur: Hibernian FC | ||||
| H (Match allé) | Leeds United | - | SSC Napoli | 2:0 (2:0) | ||
| R (match retour) | SSC Napoli | - | Leeds United | 2:0 (1:0, 2:0) ap | ||
| H (Match allé): 13.11.1968 | R (match retour): 27.11.1968 | |||||
| H (Match allé) | Hansa Rostock | - | ACF Fiorentina | 3:2 (0:0) | ||
| R (match retour) | ACF Fiorentina | - | Hansa Rostock | 2:1 (1:1) | ||
| H (Match allé): 13.11.1968 | R (match retour): 27.11.1968 | vainqueur: ACF Fiorentina | ||||
| H (Match allé) | Hamburger SV | - | SK Slavia Praha | 4:1 (3:1) | ||
| R (match retour) | SK Slavia Praha | - | Hamburger SV | 3:1 (2:0) | ||
| H (Match allé): 20.11.1968 | R (match retour): 27.11.1968 | vainqueur: Hamburger SV | ||||
| H (Match allé) | Panathinaikos | - | Athletic Club | 0:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Athletic Club | - | Panathinaikos | 1:0 (1:0) | ||
| H (Match allé): 20.11.1968 | R (match retour): 27.11.1968 | vainqueur: Athletic Club | ||||
