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| 22.11.2008 | 14:00 | FK Dukla Banská Bystrica | - | FC DAC 1904 | 0:0 | |
| 16:00 | MFK Ružomberok | - | Zlaté Moravce | 1:0 (0:0) | ||
| 16:30 | MFK Košice | - | FC Artmedia Petržalka | 1:2 (0:1) | ||
| 17:30 | MFK Dubnica | - | 1. FC Tatran Prešov | 0:0 | ||
| 20:15 | Spartak Trnava | - | FC Nitra | 3:1 (2:1) | ||
| 23.11.2008 | 17:15 | Slovan Bratislava | - | MŠK Žilina | 2:0 (1:0) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Slovan Bratislava | 17 | 11 | 4 | 2 | 38:12 | 26 | 37 |
| 2 |
|
MŠK Žilina | 17 | 10 | 3 | 4 | 32:11 | 21 | 33 |
| 3 |
|
Spartak Trnava | 17 | 9 | 5 | 3 | 26:18 | 8 | 32 |
| 4 |
|
MFK Košice | 17 | 7 | 6 | 4 | 26:23 | 3 | 27 |
| 5 |
|
MFK Ružomberok | 17 | 6 | 6 | 5 | 23:18 | 5 | 24 |
| 6 |
|
FC DAC 1904 | 17 | 6 | 6 | 5 | 21:21 | 0 | 24 |
| 7 |
|
1. FC Tatran Prešov | 17 | 6 | 4 | 7 | 19:28 | -9 | 22 |
| 8 |
|
MFK Dubnica | 17 | 5 | 4 | 8 | 23:25 | -2 | 19 |
| 9 |
|
FC Artmedia Petržalka | 17 | 4 | 5 | 8 | 21:27 | -6 | 17 |
| 10 |
|
FK Dukla Banská Bystrica | 17 | 4 | 5 | 8 | 10:17 | -7 | 17 |
| 11 |
|
FC Nitra | 17 | 4 | 3 | 10 | 15:33 | -18 | 15 |
| 12 |
|
Zlaté Moravce | 17 | 2 | 5 | 10 | 8:29 | -21 | 11 |
