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| 09.04.2013 | 15:00 | FK Šiauliai | - | Tauras Tauragė | 4:2 | |
| 18:00 | FK Atlantas | - | FK Dainava Alytus | 6:1 | ||
| 10.04.2013 | 16:30 | FK Sūduva | - | Kruoja Pakruojis | 0:1 | |
| 18:30 | VMFD Žalgiris | - | FK Ekranas | 2:0 |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FK Atlantas | 5 | 4 | 0 | 1 | 11:5 | 6 | 12 |
| 2 |
|
VMFD Žalgiris | 5 | 4 | 0 | 1 | 8:2 | 6 | 12 |
| 3 |
|
Kruoja Pakruojis | 5 | 4 | 0 | 1 | 11:7 | 4 | 12 |
| 4 |
|
FK Ekranas | 5 | 3 | 1 | 1 | 13:7 | 6 | 10 |
| 5 |
|
FK Sūduva | 6 | 2 | 2 | 2 | 12:5 | 7 | 8 |
| 6 |
|
FK Šiauliai | 5 | 2 | 2 | 1 | 8:5 | 3 | 8 |
| 7 |
|
Banga Gargždai | 5 | 1 | 1 | 3 | 3:10 | -7 | 4 |
| 8 |
|
FK Dainava Alytus | 6 | 1 | 0 | 5 | 5:18 | -13 | 3 |
| 9 |
|
Tauras Tauragė | 6 | 0 | 0 | 6 | 4:16 | -12 | 0 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. |
