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| 21.08.2012 | Kruoja Pakruojis | - | REO Vilnius | 3:0 | ||
| 18:00 | FK Sūduva | - | FK Atlantas | 2:0 | ||
| 22.08.2012 | 18:30 | FK Šiauliai | - | VMFD Žalgiris | 2:4 (0:1) | |
| 23.08.2012 | 17:00 | Tauras Tauragė | - | FK Dainava Alytus | 1:3 | |
| 26.09.2012 | 18:00 | FK Ekranas | - | Banga Gargždai | 2:0 |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FK Ekranas | 25 | 18 | 6 | 1 | 55:18 | 37 | 60 |
| 2 |
|
VMFD Žalgiris | 25 | 16 | 6 | 3 | 48:14 | 34 | 54 |
| 3 |
|
FK Sūduva | 25 | 15 | 5 | 5 | 51:27 | 24 | 50 |
| 4 |
|
Kruoja Pakruojis | 25 | 13 | 4 | 8 | 35:22 | 13 | 43 |
| 5 |
|
FK Šiauliai | 25 | 12 | 3 | 10 | 55:41 | 14 | 39 |
| 6 |
|
Banga Gargždai | 25 | 7 | 7 | 11 | 22:28 | -6 | 28 |
| 7 |
|
FK Dainava Alytus | 25 | 7 | 4 | 14 | 32:46 | -14 | 25 |
| 8 |
|
REO Vilnius | 25 | 5 | 4 | 16 | 26:48 | -22 | 19 |
| 9 |
|
Tauras Tauragė | 25 | 6 | 1 | 18 | 26:61 | -35 | 19 |
| 10 |
|
FK Atlantas | 25 | 4 | 4 | 17 | 14:59 | -45 | 16 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Relégation |
