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| 28.04.2017 | 18:00 | FC Levadia | - | Pärnu JK Vaprus | 8:0 (3:0) | |
| 18:00 | Tulevik Viljandi | - | FC Flora | 0:2 (0:2) | ||
| 18:30 | JK Tammeka | - | JK Nõmme Kalju | 1:3 (0:2) | ||
| 29.04.2017 | 12:00 | JK Narva Trans | - | JK Sillamäe Kalev | 3:1 (2:1) | |
| 30.04.2017 | 18:00 | FC Infonet | - | Paide Linnameeskond | 6:1 (2:0) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Levadia | 9 | 7 | 2 | 0 | 30:3 | 27 | 23 |
| 2 |
|
FC Flora | 9 | 7 | 2 | 0 | 20:4 | 16 | 23 |
| 3 |
|
JK Nõmme Kalju | 9 | 6 | 2 | 1 | 25:9 | 16 | 20 |
| 4 |
|
JK Narva Trans | 9 | 5 | 1 | 3 | 18:13 | 5 | 16 |
| 5 |
|
FC Infonet | 9 | 4 | 1 | 4 | 23:11 | 12 | 13 |
| 6 |
|
JK Tammeka | 9 | 2 | 4 | 3 | 10:14 | -4 | 10 |
| 7 |
|
Paide Linnameeskond | 9 | 3 | 1 | 5 | 11:28 | -17 | 10 |
| 8 |
|
Tulevik Viljandi | 9 | 2 | 0 | 7 | 7:26 | -19 | 6 |
| 9 |
|
JK Sillamäe Kalev | 9 | 1 | 2 | 6 | 9:19 | -10 | 5 |
| 10 |
|
Pärnu JK Vaprus | 9 | 0 | 1 | 8 | 7:33 | -26 | 1 |
| Champions League Quali. | |
| Relégation |
