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| 15.08.2016 | 18:00 | JK Nõmme Kalju | - | JK Narva Trans | 2:0 (0:0) | |
| 16.08.2016 | 17:00 | Pärnu Linnameeskond | - | FC Infonet | 0:5 (0:2) | |
| 18:00 | Paide Linnameeskond | - | JK Sillamäe Kalev | 1:3 (1:1) | ||
| 18:00 | Rakvere JK Tarvas | - | FC Flora | 1:4 (0:3) | ||
| 19:00 | JK Tammeka | - | FC Levadia | 1:2 (1:0) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Infonet | 24 | 17 | 5 | 2 | 58:22 | 36 | 56 |
| 2 |
|
FC Levadia | 24 | 16 | 5 | 3 | 46:19 | 27 | 53 |
| 3 |
|
JK Nõmme Kalju | 24 | 15 | 7 | 2 | 46:14 | 32 | 52 |
| 4 |
|
FC Flora | 24 | 14 | 7 | 3 | 61:16 | 45 | 49 |
| 5 |
|
JK Sillamäe Kalev | 24 | 9 | 7 | 8 | 39:30 | 9 | 34 |
| 6 |
|
Paide Linnameeskond | 24 | 8 | 5 | 11 | 36:43 | -7 | 29 |
| 7 |
|
JK Tammeka | 24 | 7 | 5 | 12 | 24:42 | -18 | 26 |
| 8 |
|
JK Narva Trans | 24 | 5 | 6 | 13 | 34:51 | -17 | 21 |
| 9 |
|
Pärnu Linnameeskond | 24 | 4 | 1 | 19 | 11:56 | -45 | 13 |
| 10 |
|
Rakvere JK Tarvas | 24 | 0 | 2 | 22 | 13:75 | -62 | 2 |
| Champions League Quali. | |
| Relégation | |
| Relégation |
