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| Classement | » équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Flora | 15 | 9 | 2 | 4 | 26:11 | 15 | 29 |
| 2 |
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JK Nõmme Kalju | 12 | 9 | 1 | 2 | 26:9 | 17 | 28 |
| 3 |
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JK Sillamäe Kalev | 13 | 7 | 4 | 2 | 26:14 | 12 | 25 |
| 4 |
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FC Infonet | 14 | 7 | 4 | 3 | 26:16 | 10 | 25 |
| 5 |
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FC Levadia | 11 | 7 | 3 | 1 | 17:7 | 10 | 24 |
| 6 |
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JK Narva Trans | 13 | 6 | 3 | 4 | 23:12 | 11 | 21 |
| 7 |
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Tulevik Viljandi | 13 | 4 | 2 | 7 | 16:22 | -6 | 14 |
| 8 |
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Paide Linnameeskond | 13 | 4 | 2 | 7 | 25:34 | -9 | 14 |
| 9 |
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JK Tammeka | 13 | 3 | 2 | 8 | 16:33 | -17 | 11 |
| 10 |
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Pärnu Linnameeskond | 13 | 2 | 3 | 8 | 15:34 | -19 | 9 |
| 11 |
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Rakvere JK Tarvas | 0 | 0 | 0 | 0 | 0:0 | 0 | 0 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Relégation | |
| Relégation |
