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| 05.10.2013 | 13:00 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 2:2 (1:1) | |
| 16:00 | JK Tallinna Kalev | - | JK Narva Trans | 0:4 (0:1) | ||
| 16:00 | JK Sillamäe Kalev | - | FC Levadia | 1:2 (1:1) | ||
| 22.10.2013 | 16:30 | FC Infonet | - | Paide Linnameeskond | 1:2 (0:2) | |
| 06.11.2013 | 18:30 | JK Tammeka | - | FC Kuressaare | 3:2 (1:1) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Levadia | 32 | 26 | 1 | 5 | 58:21 | 37 | 79 |
| 2 |
|
JK Nõmme Kalju | 32 | 22 | 6 | 4 | 64:21 | 43 | 72 |
| 3 |
|
JK Sillamäe Kalev | 32 | 19 | 6 | 7 | 52:22 | 30 | 63 |
| 4 |
|
FC Flora | 32 | 19 | 5 | 8 | 74:34 | 40 | 62 |
| 5 |
|
Paide Linnameeskond | 32 | 14 | 2 | 16 | 41:52 | -11 | 44 |
| 6 |
|
FC Infonet | 32 | 9 | 8 | 15 | 32:43 | -11 | 35 |
| 7 |
|
JK Tallinna Kalev | 32 | 9 | 4 | 19 | 30:62 | -32 | 31 |
| 8 |
|
JK Narva Trans | 32 | 9 | 3 | 20 | 31:49 | -18 | 30 |
| 9 |
|
JK Tammeka | 32 | 7 | 8 | 17 | 28:54 | -26 | 29 |
| 10 |
|
FC Kuressaare | 32 | 2 | 5 | 25 | 19:71 | -52 | 11 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Relégation | |
| Relégation |
