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| 20.05.2013 | 18:30 | FC Infonet | - | FC Levadia | 0:1 (0:0) | |
| 21.05.2013 | 18:30 | JK Nõmme Kalju | - | JK Tallinna Kalev | 2:0 (0:0) | |
| 18:30 | JK Sillamäe Kalev | - | JK Tammeka | 1:1 (0:1) | ||
| 18:30 | FC Flora | - | FC Kuressaare | 6:0 (1:0) | ||
| 18:30 | Paide Linnameeskond | - | JK Narva Trans | 0:1 (0:0) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
JK Nõmme Kalju | 12 | 10 | 1 | 1 | 26:6 | 20 | 31 |
| 2 |
|
FC Levadia | 12 | 10 | 1 | 1 | 21:7 | 14 | 31 |
| 3 |
|
FC Flora | 12 | 9 | 1 | 2 | 35:10 | 25 | 28 |
| 4 |
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JK Sillamäe Kalev | 12 | 5 | 4 | 3 | 16:10 | 6 | 19 |
| 5 |
|
Paide Linnameeskond | 12 | 6 | 0 | 6 | 16:18 | -2 | 18 |
| 6 |
|
JK Tallinna Kalev | 12 | 3 | 2 | 7 | 7:18 | -11 | 11 |
| 7 |
|
FC Infonet | 12 | 2 | 4 | 6 | 6:17 | -11 | 10 |
| 8 |
|
JK Tammeka | 12 | 2 | 3 | 7 | 8:19 | -11 | 9 |
| 9 |
|
JK Narva Trans | 12 | 2 | 2 | 8 | 7:20 | -13 | 8 |
| 10 |
|
FC Kuressaare | 12 | 1 | 2 | 9 | 6:23 | -17 | 5 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Relégation | |
| Relégation |
