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| 28.07.2012 | 16:00 | JK Tammeka | - | JK Tallinna Kalev | 1:1 (0:1) | |
| 18:30 | JK Sillamäe Kalev | - | JK Nõmme Kalju | 0:2 (0:1) | ||
| 18:30 | JK Narva Trans | - | FC Viljandi | 1:1 (1:1) | ||
| 30.07.2012 | 17:45 | FC Flora | - | Paide Linnameeskond | 3:0 (0:0) | |
| 17:45 | FC Levadia | - | FC Kuressaare | 7:0 (3:0) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
JK Nõmme Kalju | 21 | 18 | 2 | 1 | 53:7 | 46 | 56 |
| 2 |
|
FC Levadia | 21 | 15 | 6 | 0 | 49:6 | 43 | 51 |
| 3 |
|
FC Flora | 21 | 15 | 1 | 5 | 44:11 | 33 | 46 |
| 4 |
|
JK Sillamäe Kalev | 21 | 7 | 8 | 6 | 23:24 | -1 | 29 |
| 5 |
|
JK Narva Trans | 21 | 8 | 4 | 9 | 25:26 | -1 | 28 |
| 6 |
|
Paide Linnameeskond | 21 | 7 | 3 | 11 | 18:32 | -14 | 24 |
| 7 |
|
FC Viljandi | 21 | 4 | 5 | 12 | 20:40 | -20 | 17 |
| 8 |
|
JK Tallinna Kalev | 21 | 4 | 5 | 12 | 18:47 | -29 | 17 |
| 9 |
|
FC Kuressaare | 21 | 3 | 7 | 11 | 15:42 | -27 | 16 |
| 10 |
|
JK Tammeka | 21 | 1 | 5 | 15 | 12:42 | -30 | 8 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Relégation | |
| Relégation |
