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| 17.03.2012 | 13:00 | FC Levadia | - | JK Narva Trans | 4:0 (0:0) | |
| 13:00 | FC Viljandi | - | FC Flora | 0:2 (0:1) | ||
| 16:00 | JK Tammeka | - | JK Sillamäe Kalev | 0:0 (0:0) | ||
| 16:00 | JK Tallinna Kalev | - | Paide Linnameeskond | 1:0 (1:0) | ||
| 09.10.2012 | 15:30 | FC Kuressaare | - | JK Nõmme Kalju | 0:1 (0:0) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Flora | 2 | 2 | 0 | 0 | 4:0 | 4 | 6 |
| 2 |
|
JK Tallinna Kalev | 2 | 2 | 0 | 0 | 3:1 | 2 | 6 |
| 3 |
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FC Levadia | 2 | 1 | 1 | 0 | 4:0 | 4 | 4 |
| 4 |
|
JK Nõmme Kalju | 2 | 1 | 1 | 0 | 1:0 | 1 | 4 |
| 5 |
|
Paide Linnameeskond | 2 | 1 | 0 | 1 | 2:2 | 0 | 3 |
| 6 |
|
JK Narva Trans | 2 | 1 | 0 | 1 | 2:4 | -2 | 3 |
| 7 |
|
JK Sillamäe Kalev | 2 | 0 | 1 | 1 | 0:2 | -2 | 1 |
|
JK Tammeka | 2 | 0 | 1 | 1 | 0:2 | -2 | 1 | |
| 9 |
|
FC Viljandi | 2 | 0 | 0 | 2 | 1:4 | -3 | 0 |
| 10 |
|
FC Kuressaare | 2 | 0 | 0 | 2 | 1:3 | -2 | 0 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Relégation | |
| Relégation |
