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| 03.10.2009 | 13:00 | JK Tallinna Kalev | - | FC Levadia | 0:1 (0:0) | |
| 13:00 | FC Kuressaare | - | Paide Linnameeskond | 4:1 (1:0) | ||
| 13:00 | JK Sillamäe Kalev | - | JK Tammeka | 3:0 (1:0) | ||
| 13:00 | Tulevik Viljandi | - | JK Nõmme Kalju | 3:2 (2:2) | ||
| 16:00 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 1:2 (1:1) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Levadia | 30 | 26 | 4 | 0 | 105:19 | 86 | 82 |
| 2 |
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JK Sillamäe Kalev | 30 | 22 | 3 | 5 | 75:30 | 45 | 69 |
| 3 |
|
JK Narva Trans | 30 | 18 | 6 | 6 | 72:26 | 46 | 60 |
| 4 |
|
FC Flora | 30 | 16 | 6 | 8 | 56:29 | 27 | 54 |
| 5 |
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JK Nõmme Kalju | 29 | 13 | 6 | 10 | 57:38 | 19 | 45 |
| 6 |
|
Tulevik Viljandi | 30 | 12 | 6 | 12 | 40:40 | 0 | 42 |
| 7 |
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Paide Linnameeskond | 30 | 6 | 4 | 20 | 17:76 | -59 | 22 |
| 8 |
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FC Kuressaare | 29 | 6 | 3 | 20 | 19:84 | -65 | 21 |
| 9 |
|
JK Tammeka | 30 | 5 | 2 | 23 | 25:77 | -52 | 17 |
| 10 |
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JK Tallinna Kalev | 30 | 3 | 4 | 23 | 25:72 | -47 | 13 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League | |
| Relégation | |
| Relégation |
