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| 22.08.2009 | 16:00 | JK Narva Trans | - | FC Flora | 0:0 (0:0) | |
| 16:00 | Paide Linnameeskond | - | FC Kuressaare | 2:0 (0:0) | ||
| 16:00 | JK Nõmme Kalju | - | Tulevik Viljandi | 1:1 (0:1) | ||
| 18:30 | JK Tammeka | - | JK Sillamäe Kalev | 1:2 (0:1) | ||
| 23.08.2009 | 16:00 | FC Levadia | - | JK Tallinna Kalev | 5:1 (3:0) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Levadia | 25 | 21 | 4 | 0 | 89:17 | 72 | 67 |
| 2 |
|
JK Sillamäe Kalev | 25 | 17 | 3 | 5 | 62:28 | 34 | 54 |
| 3 |
|
FC Flora | 25 | 16 | 5 | 4 | 50:18 | 32 | 53 |
| 4 |
|
JK Narva Trans | 25 | 14 | 5 | 6 | 48:23 | 25 | 47 |
| 5 |
|
JK Nõmme Kalju | 24 | 11 | 5 | 8 | 45:27 | 18 | 38 |
| 6 |
|
Tulevik Viljandi | 25 | 10 | 6 | 9 | 32:31 | 1 | 36 |
| 7 |
|
Paide Linnameeskond | 25 | 6 | 3 | 16 | 14:63 | -49 | 21 |
| 8 |
|
FC Kuressaare | 24 | 5 | 3 | 16 | 14:55 | -41 | 18 |
| 9 |
|
JK Tallinna Kalev | 25 | 2 | 4 | 19 | 20:59 | -39 | 10 |
| 10 |
|
JK Tammeka | 25 | 2 | 2 | 21 | 17:70 | -53 | 8 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League | |
| Relégation | |
| Relégation |
