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| 01.11.2008 | 13:00 | FC Levadia | - | JK Sillamäe Kalev | 5:1 | |
| 13:00 | JK Tallinna Kalev | - | Pärnu JK Vaprus | 1:1 | ||
| 13:00 | Tulevik Viljandi | - | JK Maag Tammeka | 3:0 | ||
| 13:00 | JK Narva Trans | - | JK Nõmme Kalju | 1:1 | ||
| 16:00 | FC Flora | - | FC TVMK | 4:2 |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Levadia | 34 | 28 | 5 | 1 | 103:21 | 82 | 89 |
| 2 |
|
FC Flora | 34 | 26 | 7 | 1 | 101:25 | 76 | 85 |
| 3 |
|
FC TVMK | 34 | 20 | 5 | 9 | 89:44 | 45 | 65 |
| 4 |
|
JK Narva Trans | 34 | 16 | 8 | 10 | 62:52 | 10 | 56 |
| 5 |
|
JK Nõmme Kalju | 34 | 14 | 7 | 13 | 60:62 | -2 | 49 |
| 6 |
|
JK Sillamäe Kalev | 34 | 11 | 6 | 17 | 44:76 | -32 | 39 |
| 7 |
|
JK Maag Tammeka | 34 | 8 | 4 | 22 | 42:70 | -28 | 28 |
| 8 |
|
Tulevik Viljandi | 34 | 8 | 4 | 22 | 30:72 | -42 | 28 |
| 9 |
|
JK Tallinna Kalev | 34 | 6 | 8 | 20 | 35:66 | -31 | 26 |
| 10 |
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Pärnu JK Vaprus | 34 | 5 | 2 | 27 | 38:116 | -78 | 17 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League | |
| Relégation | |
| Relégation |
