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| 20.09.2008 | 13:00 | FC Levadia | - | Tulevik Viljandi | 5:0 | |
| 13:00 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 0:3 | ||
| 13:00 | JK Maag Tammeka | - | JK Sillamäe Kalev | 0:2 | ||
| 13:00 | Pärnu JK Vaprus | - | FC TVMK | 3:10 | ||
| 16:00 | JK Narva Trans | - | JK Tallinna Kalev | 1:0 |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Levadia | 28 | 23 | 4 | 1 | 87:17 | 70 | 73 |
| 2 |
|
FC Flora | 28 | 22 | 5 | 1 | 91:20 | 71 | 71 |
| 3 |
|
FC TVMK | 28 | 17 | 5 | 6 | 72:35 | 37 | 56 |
| 4 |
|
JK Narva Trans | 28 | 13 | 7 | 8 | 52:45 | 7 | 46 |
| 5 |
|
JK Nõmme Kalju | 28 | 12 | 5 | 11 | 48:51 | -3 | 41 |
| 6 |
|
JK Sillamäe Kalev | 28 | 9 | 5 | 14 | 38:68 | -30 | 32 |
| 7 |
|
JK Maag Tammeka | 28 | 7 | 4 | 17 | 36:52 | -16 | 25 |
| 8 |
|
JK Tallinna Kalev | 28 | 6 | 5 | 17 | 31:52 | -21 | 23 |
| 9 |
|
Tulevik Viljandi | 28 | 4 | 4 | 20 | 21:68 | -47 | 16 |
| 10 |
|
Pärnu JK Vaprus | 28 | 5 | 0 | 23 | 32:100 | -68 | 15 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League | |
| Relégation | |
| Relégation |
