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| 23.07.2006 | 13:00 | Ajax Lasnamäe | - | Tulevik Viljandi | 1:1 | |
| 16:00 | Warrior Valga | - | FC Flora | 0:5 | ||
| 16:00 | JK Maag Tartu | - | JK Narva Trans | 2:6 | ||
| 16:00 | FC Levadia | - | FC TVMK | 3:1 | ||
| 16:00 | Pärnu JK Vaprus | - | JK Tammeka (old) | 1:1 |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Levadia | 20 | 18 | 2 | 0 | 60:12 | 48 | 56 |
| 2 |
|
FC Flora | 20 | 14 | 2 | 4 | 47:18 | 29 | 44 |
| 3 |
|
JK Narva Trans | 20 | 12 | 6 | 2 | 58:23 | 35 | 42 |
| 4 |
|
FC TVMK | 20 | 12 | 2 | 6 | 49:20 | 29 | 38 |
| 5 |
|
JK Tammeka (old) | 20 | 8 | 4 | 8 | 26:29 | -3 | 28 |
| 6 |
|
JK Maag Tartu | 20 | 7 | 5 | 8 | 33:36 | -3 | 26 |
| 7 |
|
Pärnu JK Vaprus | 20 | 6 | 2 | 12 | 28:47 | -19 | 20 |
| 8 |
|
Ajax Lasnamäe | 20 | 4 | 2 | 14 | 21:59 | -38 | 14 |
| 9 |
|
Tulevik Viljandi | 20 | 3 | 4 | 13 | 15:38 | -23 | 13 |
| 10 |
|
Warrior Valga | 20 | 1 | 1 | 18 | 7:62 | -55 | 4 |
