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| 21.06.2006 | 18:30 | Warrior Valga | - | FC Levadia | 0:4 | |
| 18:30 | JK Maag Tartu | - | Pärnu JK Vaprus | 0:3 | ||
| 18:30 | FC Flora | - | Ajax Lasnamäe | 6:0 | ||
| 18:30 | JK Narva Trans | - | Tulevik Viljandi | 6:1 | ||
| 18:30 | FC TVMK | - | JK Tammeka (old) | 1:1 |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Levadia | 16 | 14 | 2 | 0 | 51:9 | 42 | 44 |
| 2 |
|
FC Flora | 16 | 11 | 2 | 3 | 36:15 | 21 | 35 |
| 3 |
|
JK Narva Trans | 16 | 9 | 6 | 1 | 41:15 | 26 | 33 |
| 4 |
|
FC TVMK | 16 | 9 | 2 | 5 | 35:15 | 20 | 29 |
| 5 |
|
JK Maag Tartu | 16 | 6 | 5 | 5 | 29:26 | 3 | 23 |
| 6 |
|
JK Tammeka (old) | 16 | 6 | 2 | 8 | 20:27 | -7 | 20 |
| 7 |
|
Pärnu JK Vaprus | 16 | 6 | 1 | 9 | 21:33 | -12 | 19 |
| 8 |
|
Ajax Lasnamäe | 16 | 4 | 1 | 11 | 19:45 | -26 | 13 |
| 9 |
|
Tulevik Viljandi | 16 | 2 | 2 | 12 | 12:35 | -23 | 8 |
| 10 |
|
Warrior Valga | 16 | 1 | 1 | 14 | 7:51 | -44 | 4 |
