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| Classement | équipe recevante | » à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Zlín | 15 | 9 | 5 | 1 | 19:7 | 12 | 32 |
| 2 |
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MFK Chrudim | 14 | 7 | 4 | 3 | 19:12 | 7 | 25 |
| 3 |
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FK MAS Táborsko | 14 | 6 | 5 | 3 | 21:16 | 5 | 23 |
| 4 |
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MFK Vyškov | 14 | 6 | 4 | 4 | 18:11 | 7 | 22 |
| 5 |
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Zbrojovka Brno | 15 | 6 | 4 | 5 | 22:20 | 2 | 22 |
| 6 |
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SK Líšeň | 14 | 4 | 7 | 3 | 17:15 | 2 | 19 |
| 7 |
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Baník Ostrava B | 15 | 4 | 5 | 6 | 16:24 | -8 | 17 |
| 8 |
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Viktoria Žižkov | 15 | 4 | 4 | 7 | 20:24 | -4 | 16 |
| 9 |
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FC Sellier & Bellot Vlašim | 15 | 2 | 9 | 4 | 19:21 | -2 | 15 |
| 10 |
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AC Sparta Praha B | 14 | 4 | 3 | 7 | 16:24 | -8 | 15 |
| 11 |
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FK Varnsdorf | 14 | 3 | 5 | 6 | 18:18 | 0 | 14 |
| 12 |
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Slavia Praha B | 15 | 3 | 5 | 7 | 20:23 | -3 | 14 |
| 13 |
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SFC Opava | 14 | 3 | 5 | 6 | 8:19 | -11 | 14 |
| 14 |
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1. SK Prostějov | 15 | 3 | 4 | 8 | 13:27 | -14 | 13 |
| 15 |
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Vysočina Jihlava | 14 | 2 | 5 | 7 | 11:22 | -11 | 11 |
| 16 |
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Sigma Olomouc B | 15 | 1 | 0 | 14 | 8:34 | -26 | 3 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation |
