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| Classement | » équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Zlín | 13 | 10 | 3 | 0 | 22:5 | 17 | 33 |
| 2 |
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MFK Chrudim | 14 | 8 | 3 | 3 | 27:15 | 12 | 27 |
| 3 |
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Vysočina Jihlava | 14 | 6 | 6 | 2 | 22:15 | 7 | 24 |
| 4 |
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AC Sparta Praha B | 14 | 5 | 7 | 2 | 24:14 | 10 | 22 |
| 5 |
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FC Sellier & Bellot Vlašim | 13 | 6 | 3 | 4 | 21:17 | 4 | 21 |
| 6 |
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1. SK Prostějov | 13 | 5 | 6 | 2 | 17:13 | 4 | 21 |
| 7 |
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SFC Opava | 14 | 6 | 3 | 5 | 21:18 | 3 | 21 |
| 8 |
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Viktoria Žižkov | 13 | 6 | 2 | 5 | 25:22 | 3 | 20 |
| 9 |
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Slavia Praha B | 13 | 5 | 4 | 4 | 19:13 | 6 | 19 |
| 10 |
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Sigma Olomouc B | 13 | 4 | 6 | 3 | 20:16 | 4 | 18 |
| 11 |
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MFK Vyškov | 14 | 4 | 6 | 4 | 11:13 | -2 | 18 |
| 12 |
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SK Líšeň | 14 | 4 | 5 | 5 | 10:16 | -6 | 17 |
| 13 |
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FK MAS Táborsko | 14 | 4 | 3 | 7 | 12:13 | -1 | 15 |
| 14 |
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FK Varnsdorf | 14 | 4 | 3 | 7 | 16:23 | -7 | 15 |
| 15 |
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Baník Ostrava B | 13 | 4 | 1 | 8 | 18:22 | -4 | 13 |
| 16 |
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Zbrojovka Brno | 13 | 2 | 7 | 4 | 15:20 | -5 | 13 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation |
