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| 26.02.1999 | 20:00 | Club Brugge KV | - | Sporting Lokeren | 4:0 (1:0) | |
| 27.02.1999 | 20:00 | Lommelse SK | - | K.S.C. Eendracht Aalst | 0:3 (0:1) | |
| 20:00 | KVC Westerlo | - | Lierse SK (old) | 0:2 (0:1) | ||
| 20:00 | Sint-Truidense VV | - | RSC Anderlecht | 1:4 (0:1) | ||
| 20:00 | RSC Charleroi | - | KAA Gent | 1:1 (0:1) | ||
| 20:00 | KSK Beveren | - | Standard Liège | 0:6 (0:4) | ||
| 20:00 | Excelsior Mouscron | - | KV Oostende | 2:1 (2:1) | ||
| 28.02.1999 | 15:00 | Germinal Beerschot | - | KRC Harelbeke | 0:2 (0:1) | |
| 10.03.1999 | 20:00 | KV Kortrijk | - | KRC Genk | 1:3 (0:1) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
KRC Genk | 24 | 16 | 5 | 3 | 54:27 | 27 | 53 |
| 2 |
|
Club Brugge KV | 24 | 16 | 4 | 4 | 46:22 | 24 | 52 |
| 3 |
|
Excelsior Mouscron | 24 | 13 | 7 | 4 | 54:36 | 18 | 46 |
| 4 |
|
RSC Anderlecht | 24 | 13 | 5 | 6 | 47:33 | 14 | 44 |
| 5 |
|
Standard Liège | 24 | 13 | 2 | 9 | 43:27 | 16 | 41 |
| 6 |
|
KAA Gent | 24 | 11 | 8 | 5 | 41:39 | 2 | 41 |
| 7 |
|
Sporting Lokeren | 24 | 12 | 4 | 8 | 49:39 | 10 | 40 |
| 8 |
|
Sint-Truidense VV | 24 | 11 | 6 | 7 | 33:28 | 5 | 39 |
| 9 |
|
Lierse SK (old) | 24 | 11 | 3 | 10 | 45:37 | 8 | 36 |
| 10 |
|
Germinal Beerschot | 24 | 10 | 4 | 10 | 36:36 | 0 | 34 |
| 11 |
|
KVC Westerlo | 24 | 9 | 3 | 12 | 43:45 | -2 | 30 |
| 12 |
|
KRC Harelbeke | 24 | 7 | 8 | 9 | 31:36 | -5 | 29 |
| 13 |
|
K.S.C. Eendracht Aalst | 24 | 8 | 5 | 11 | 34:41 | -7 | 29 |
| 14 |
|
RSC Charleroi | 24 | 4 | 10 | 10 | 28:37 | -9 | 22 |
| 15 |
|
Lommelse SK | 24 | 5 | 4 | 15 | 23:39 | -16 | 19 |
| 16 |
|
KSK Beveren | 24 | 4 | 5 | 15 | 24:47 | -23 | 17 |
| 17 |
|
KV Kortrijk | 24 | 3 | 5 | 16 | 33:62 | -29 | 14 |
| 18 |
|
KV Oostende | 24 | 2 | 8 | 14 | 22:55 | -33 | 14 |
