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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | » 1. Mi-temps | 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Energie Cottbus (N) | 20 | 14 | 4 | 2 | 25:11 | 14 | 46 |
| 2 |
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Erzgebirge Aue | 20 | 9 | 6 | 5 | 22:15 | 7 | 33 |
| 3 |
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SC Verl | 20 | 8 | 8 | 4 | 17:14 | 3 | 32 |
| 4 |
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1. FC Saarbrücken | 20 | 7 | 9 | 4 | 15:10 | 5 | 30 |
| 5 |
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Viktoria Köln | 20 | 8 | 5 | 7 | 12:11 | 1 | 29 |
| 6 |
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Hansa Rostock (A) | 20 | 8 | 5 | 7 | 11:10 | 1 | 29 |
| 7 |
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Dynamo Dresden | 20 | 7 | 6 | 7 | 15:13 | 2 | 27 |
| 8 |
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SV Wehen Wiesbaden (A) | 20 | 7 | 6 | 7 | 14:18 | -4 | 27 |
| 9 |
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FC Ingolstadt 04 | 20 | 6 | 8 | 6 | 19:16 | 3 | 26 |
| 10 |
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VfB Stuttgart II (N) | 20 | 8 | 2 | 10 | 16:17 | -1 | 26 |
| 11 |
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Borussia Dortmund II | 20 | 5 | 10 | 5 | 17:16 | 1 | 25 |
| 12 |
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Alemannia Aachen (N) | 20 | 5 | 10 | 5 | 9:9 | 0 | 25 |
| 13 |
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TSV 1860 München | 20 | 6 | 6 | 8 | 12:16 | -4 | 24 |
| 14 |
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Hannover 96 II (N) | 20 | 5 | 8 | 7 | 12:17 | -5 | 23 |
| 15 |
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VfL Osnabrück (A) | 20 | 5 | 7 | 8 | 11:16 | -5 | 22 |
| 16 |
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Rot-Weiss Essen | 20 | 4 | 9 | 7 | 10:11 | -1 | 21 |
| 17 |
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Waldhof Mannheim | 20 | 3 | 12 | 5 | 8:11 | -3 | 21 |
| 18 |
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SV Sandhausen | 20 | 4 | 9 | 7 | 11:16 | -5 | 21 |
| 19 |
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Arminia Bielefeld | 20 | 3 | 11 | 6 | 6:10 | -4 | 20 |
| 20 |
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SpVgg Unterhaching | 20 | 1 | 13 | 6 | 10:15 | -5 | 16 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation |
