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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | » 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Jahn Regensburg (A) | 20 | 10 | 8 | 2 | 20:10 | 10 | 38 |
| 2 |
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Dynamo Dresden | 20 | 11 | 5 | 4 | 17:8 | 9 | 38 |
| 3 |
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FC Ingolstadt 04 | 20 | 11 | 3 | 6 | 25:15 | 10 | 36 |
| 4 |
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Rot-Weiss Essen | 20 | 7 | 10 | 3 | 17:14 | 3 | 31 |
| 5 |
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Viktoria Köln | 20 | 7 | 9 | 4 | 20:17 | 3 | 30 |
| 6 |
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SSV Ulm 1846 (N) | 20 | 7 | 7 | 6 | 16:13 | 3 | 28 |
| 7 |
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1. FC Saarbrücken | 20 | 5 | 12 | 3 | 19:12 | 7 | 27 |
| 8 |
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SpVgg Unterhaching (N) | 20 | 6 | 9 | 5 | 13:12 | 1 | 27 |
| 9 |
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SV Sandhausen (A) | 20 | 6 | 9 | 5 | 13:16 | -3 | 27 |
| 10 |
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SC Verl | 20 | 6 | 8 | 6 | 21:17 | 4 | 26 |
| 11 |
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Erzgebirge Aue | 20 | 6 | 7 | 7 | 15:15 | 0 | 25 |
| 12 |
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TSV 1860 München | 20 | 6 | 7 | 7 | 9:12 | -3 | 25 |
| 13 |
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Hallescher FC | 20 | 7 | 4 | 9 | 16:20 | -4 | 25 |
| 14 |
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Preußen Münster (N) | 20 | 5 | 9 | 6 | 21:19 | 2 | 24 |
| 15 |
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Borussia Dortmund II | 20 | 5 | 9 | 6 | 12:11 | 1 | 24 |
| 16 |
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Arminia Bielefeld (A) | 20 | 4 | 11 | 5 | 17:17 | 0 | 23 |
| 17 |
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MSV Duisburg | 20 | 4 | 8 | 8 | 8:16 | -8 | 20 |
| 18 |
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Waldhof Mannheim | 20 | 5 | 3 | 12 | 9:22 | -13 | 18 |
| 19 |
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VfB Lübeck (N) | 20 | 3 | 8 | 9 | 11:20 | -9 | 17 |
| 20 |
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SC Freiburg II | 20 | 2 | 8 | 10 | 7:20 | -13 | 14 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation |
