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| Classement | équipe recevante | » à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Carl Zeiss Jena | 17 | 6 | 6 | 5 | 22:23 | -1 | 24 |
| 2 |
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FC Ingolstadt 04 | 17 | 7 | 2 | 8 | 21:25 | -4 | 23 |
| 3 |
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Kickers Offenbach | 17 | 5 | 7 | 5 | 19:17 | 2 | 22 |
| 4 |
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1. FC Heidenheim 1846 | 16 | 6 | 4 | 6 | 24:25 | -1 | 22 |
| 5 |
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Werder Bremen II | 17 | 5 | 5 | 7 | 17:27 | -10 | 20 |
| 6 |
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Eintracht Braunschweig | 17 | 4 | 7 | 6 | 17:19 | -2 | 19 |
| 7 |
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Rot-Weiß Erfurt | 16 | 5 | 4 | 7 | 17:20 | -3 | 19 |
| 8 |
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VfB Stuttgart II | 16 | 6 | 1 | 9 | 17:21 | -4 | 19 |
| 9 |
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Wuppertaler SV | 16 | 5 | 3 | 8 | 17:21 | -4 | 18 |
| 10 |
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SpVgg Unterhaching | 17 | 4 | 5 | 8 | 20:26 | -6 | 17 |
| 11 |
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SV Wehen Wiesbaden | 16 | 4 | 5 | 7 | 17:27 | -10 | 17 |
| 12 |
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Bayern München II | 16 | 5 | 1 | 10 | 22:37 | -15 | 16 |
| 13 |
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Jahn Regensburg | 16 | 3 | 5 | 8 | 20:24 | -4 | 14 |
| 14 |
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VfL Osnabrück | 16 | 3 | 5 | 8 | 11:20 | -9 | 14 |
| 15 |
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Dynamo Dresden | 17 | 3 | 5 | 9 | 10:19 | -9 | 14 |
| 16 |
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SV Sandhausen | 16 | 3 | 5 | 8 | 19:30 | -11 | 14 |
| 17 |
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Borussia Dortmund II | 17 | 4 | 2 | 11 | 21:33 | -12 | 14 |
| 18 |
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Erzgebirge Aue | 16 | 3 | 5 | 8 | 13:26 | -13 | 14 |
| 19 |
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Wacker Burghausen | 17 | 3 | 4 | 10 | 11:34 | -23 | 13 |
| 20 |
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Holstein Kiel | 17 | 2 | 2 | 13 | 15:37 | -22 | 8 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation |
